Java 6 (u21)のフォント設定(fontconfig.properties)をいじって、欧文にConsolars、日本語にメイリオを使用する記述をした上で、Nimbus Look and Feelを指定してNetBeansを起動してみました。
以前(1年前くらい?)Nimbus Look and FeelでNetBeansを立ち上げてみたときは、表示が一部崩れてうまくなかったのですが、現時点ではかなりいけているように思います。
とりあえず起動メモ
C:\>"c:\Program Files (x86)\NetBeans 6.9.1\bin\netbeans.exe" --laf com.sun.java. swing.plaf.nimbus.NimbusLookAndFeel
Java 6のフォントの変更は、以下を参照